Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF41Q9H4P4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF41Q9H4P4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms