Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN2Q9H4D0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms