Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GANQ9H2C0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GANQ9H2C0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms