Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACTR3CQ9C0K3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms