Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms