Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HIRIP3Q9BW71 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HIRIP3Q9BW71 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms