Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf16Q9BUW7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms