Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms