Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TINF2Q9BSI4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TINF2Q9BSI4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms