Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HERPUD2Q9BSE4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms