Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EBF4Q9BQW3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EBF4Q9BQW3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms