Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITX2Q99697 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PITX2Q99697 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms