Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMD1Q99460 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PSMD1Q99460 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms