Protein–RNA interactions for Protein: Q96PC3

AP1S3, AP-1 complex subunit sigma-3, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S3Q96PC3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S3Q96PC3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S3Q96PC3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S3Q96PC3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S3Q96PC3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S3Q96PC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S3Q96PC3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S3Q96PC3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S3Q96PC3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S3Q96PC3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP1S3Q96PC3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S3Q96PC3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms