Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TSNARE1Q96NA8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms