Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms