Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
YTHDC1Q96MU7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
YTHDC1Q96MU7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms