Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CNBD2Q96M20 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms