Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRIMPOLQ96LW4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms