Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms