Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHAMP1Q96JM3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHAMP1Q96JM3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms