Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms