Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ABCC11Q96J66 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC11Q96J66 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC11Q96J66 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC11Q96J66 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC11Q96J66 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC11Q96J66 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC11Q96J66 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC11Q96J66 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ABCC11Q96J66 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ABCC11Q96J66 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms