Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF496Q96IT1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF496Q96IT1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms