Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MS4A3Q96HJ5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MS4A3Q96HJ5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms