Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NEURL3Q96EH8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEURL3Q96EH8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms