Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTERF3Q96E29 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms