Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC11Q96DB2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HDAC11Q96DB2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms