Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAF2Q96CS3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAF2Q96CS3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms