Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RFT1Q96AA3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RFT1Q96AA3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms