Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRF1Q92994 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRF1Q92994 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms