Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD50Q92878 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms