Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HERVK_113Q902F9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113Q902F9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms