Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RUFY2Q8WXA3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms