Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC4Q8WW27 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC4Q8WW27 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms