Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRIM41Q8WV44 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRIM41Q8WV44 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms