Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3BQ8TF42 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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