Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF548Q8NEK5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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