Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NGDNQ8NEJ9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NGDNQ8NEJ9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms