Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMG8Q8ND04 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG8Q8ND04 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms