Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH13Q8NBN7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms