Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms