Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC4Q8N9L1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms