Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSGALNACT2Q8N6G5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSGALNACT2Q8N6G5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms