Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3L3

TXLNB, Beta-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNBQ8N3L3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXLNBQ8N3L3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TXLNBQ8N3L3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TXLNBQ8N3L3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TXLNBQ8N3L3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TXLNBQ8N3L3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TXLNBQ8N3L3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms