Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LTBP4Q8N2S1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LTBP4Q8N2S1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LTBP4Q8N2S1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms