Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35Q8N283 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms