Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FMNL3Q8IVF7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FMNL3Q8IVF7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms