Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NME9Q86XW9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NME9Q86XW9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms