Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM50Q86XT4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM50Q86XT4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms